Malgré les nombreux mystères qui entoure cette intrigante famille ninja, nombres de secrets ont été percés depuis l'attaque qu'ils ont essuyés avant que leurs enfants ne soient réduits à l'état d'esclaves de guerre. C'est entre autre Hayate Mukushi qui à mené sa propre investigation sur les origines de son clan, pour finalement découvrir les prémices d'une tragédie.
Vagabonds depuis toujours, les Mukushis étaient à la base un clan qu'on disait "d'exorcistes" de par leur incroyable Dojutsu, l'Hitomi Seishin [ 瞳 精神 - L'Oeil de l'Âme ]. Leur offrant des capacités psychiques de l'ordre du paranormal, cet incroyable artifice donnait entre la capacité à son possesseur de voir et d'entendre les esprits. Avec le temps, sa maîtrise s'est affinée jusqu'à permettre "l'extraction", soit de tirer profit des âmes. Attirant les ectoplasmes comme rien d'autre, l'Hitomi Seishin offra bientôt aux Mukushis la capacité de traduire l'énergie de l'enveloppe cadavérique des apparitions en Chakra. Bien que très aléatoires, les effets n'en étaient pas moins surprenant, au risque de chambouler l'ordre naturel des choses. Et la plus terrible découverte fut la suivante : cette pupille permettait en cas d'ultime maîtrise de faire appel à un Shinigami, ange de la mort. On dit alors que les membres du clans choisirent de refuser l'utilisation trop dangereuse du Dojutsu, ce qui scinda les Mukushis en deux partis. Avec le temps, la lignée des possesseurs de l'Hitomi Seishin s'éteignit jusqu'à ne laisser comme seul possesseur Shizimaru, puis ses fils.

Mais ce don n'avait pas pesé son lot de tracas. Dès la première activation, le Mukushi est condamné à jamais à entendre les moindres murmures des âmes errantes, jusqu'à en devenir fou. Aujourd'hui encore, on doute de l'existence d'un autre possesseur de l'Hitomi Seishin... mais, qui sait?

Outre une apparence peu commune, les Mukushis ont donc, pour certains, la capacité d'activer une technique dite de Dojutsu, le fameux Hitomi Seishin. Elle ne possède pas de réelle évolution si ce n'est la maîtrise qu'en a son propre utilisateur. Plus un Mukushi est emprunt à l'utiliser, plus il accède à diverses compétences. Pour certains, ses secrets ont demandé toute une vie, pour d'autres seulement quelques années.